Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq
Póster y Resumen
| Main Authors: | , , , , , , , |
|---|---|
| Format: | Conferencia |
| Language: | Español |
| Published: |
REDBIO
2024
|
| Subjects: | |
| Online Access: | http://hdl.handle.net/20.500.12123/17797 |
| _version_ | 1855486045126131712 |
|---|---|
| author | Machado, Rodrigo Moschen, Sebastian Nicolas Conti, Gabriela Gonzalez, Sergio Alberto Burdyn, Lourdes Hopp, Horacio Esteban Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen |
| author_browse | Burdyn, Lourdes Conti, Gabriela Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen Gonzalez, Sergio Alberto Hopp, Horacio Esteban Machado, Rodrigo Moschen, Sebastian Nicolas |
| author_facet | Machado, Rodrigo Moschen, Sebastian Nicolas Conti, Gabriela Gonzalez, Sergio Alberto Burdyn, Lourdes Hopp, Horacio Esteban Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen |
| author_sort | Machado, Rodrigo |
| collection | INTA Digital |
| description | Póster y Resumen |
| format | Conferencia |
| id | INTA17797 |
| institution | Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA -Argentina) |
| language | Español |
| publishDate | 2024 |
| publishDateRange | 2024 |
| publishDateSort | 2024 |
| publisher | REDBIO |
| publisherStr | REDBIO |
| record_format | dspace |
| spelling | INTA177972024-05-29T13:18:13Z Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq Machado, Rodrigo Moschen, Sebastian Nicolas Conti, Gabriela Gonzalez, Sergio Alberto Burdyn, Lourdes Hopp, Horacio Esteban Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen Citrus PCR Análisis de Secuencias Transcriptomas Huanglongbing de los cítricos Sequence analysis Transcriptome Huanglongbing HLB Póster y Resumen El método por excelencia actualmente utilizado para la detección de HLB es la PCR en tiempo real basado en la secuencia 16S rDNA. Sin embargo, la distribución irregular de las bacterias en las plantas, genera dificultades en el proceso de muestreo y posterior análisis. Los análisis transcriptómicos permiten la identificación de un gran número de genes que la planta expresa en respuesta a la infección. Los datos generados mediante la implementación de esta estrategia permiten identificar patrones de expresión diferencial génica en plantas cítricas infectadas durante etapas tempranas de la enfermedad. Se realizaron análisis que permitieron optimizar los tiempos de muestreo a 12, 16, 20 y 24 semanas a fin de poder detectar los cambios transcriptómicos en etapas tempranas. EEA Concordia Fil: Machado, Rodrigo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina. Fil: Moschen, Sebastian Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina. Fil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Conti, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Gonzalez, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Gonzalez, Sergio Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Burdyn, Lourdes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina. Fil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Hopp; Horacio Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Di Rienzo, Julio Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Argentina Fil: Fernandez, Paula Del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Fernandez, Paula Del Carmen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina 2024-05-17T17:27:21Z 2024-05-17T17:27:21Z 2021-06 info:ar-repo/semantics/documento de conferencia info:eu-repo/semantics/conferenceObject info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://hdl.handle.net/20.500.12123/17797 1688-9266 spa info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) application/pdf REDBIO 13° Simposio REDBIO Argentina 2021.“La Biotecnología como Solución a Desafíos Pasados, Presentes y Futuros”. 07 al 11 de Junio (Modalidad virtual) |
| spellingShingle | Citrus PCR Análisis de Secuencias Transcriptomas Huanglongbing de los cítricos Sequence analysis Transcriptome Huanglongbing HLB Machado, Rodrigo Moschen, Sebastian Nicolas Conti, Gabriela Gonzalez, Sergio Alberto Burdyn, Lourdes Hopp, Horacio Esteban Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
| title | Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
| title_full | Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
| title_fullStr | Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
| title_full_unstemmed | Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
| title_short | Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
| title_sort | optimizacion de un diseno experimental para el estudio de la interaccion citrus candidatus liberibacter spp causante de la enfermedad huanglongbing mediante analisis de rna seq |
| topic | Citrus PCR Análisis de Secuencias Transcriptomas Huanglongbing de los cítricos Sequence analysis Transcriptome Huanglongbing HLB |
| url | http://hdl.handle.net/20.500.12123/17797 |
| work_keys_str_mv | AT machadorodrigo optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq AT moschensebastiannicolas optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq AT contigabriela optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq AT gonzalezsergioalberto optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq AT burdynlourdes optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq AT hopphoracioesteban optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq AT dirienzojulioalejandro optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq AT fernandezpauladelcarmen optimizaciondeundisenoexperimentalparaelestudiodelainteraccioncitruscandidatusliberibactersppcausantedelaenfermedadhuanglongbingmedianteanalisisdernaseq |