Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici

El tomate es una de las hortalizas más importantes en el mundo, siendo afectada severamente por el hongo fitopatógeno Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. El estudio del proteoma de la savia del xilema es de vital importancia, ya que determina la presencia de los genes de avirulencia, llamados gen...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Bautista F., Álvaro J., Suazo T., Andrea K.
Other Authors: Avellaneda, Carolina
Format: Tesis
Language:Español
Published: Zamorano: Escuela Agrícola Panamericana, 2020. 2020
Subjects:
ADN
Online Access:https://bdigital.zamorano.edu/handle/11036/6857
id ZAMORANO6857
record_format dspace
spelling ZAMORANO68572023-03-24T16:16:05Z Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici Bautista F., Álvaro J. Suazo T., Andrea K. Avellaneda, Carolina Colbert, Raphael ADN Genoma Patogenicidad Primers Virulencia El tomate es una de las hortalizas más importantes en el mundo, siendo afectada severamente por el hongo fitopatógeno Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. El estudio del proteoma de la savia del xilema es de vital importancia, ya que determina la presencia de los genes de avirulencia, llamados genes SIX (secretados en xilema). El objetivo de este estudio fue, evaluar la presencia de los genes SIX1 y SIX3 a través de la generación madre, primera generación y segunda generación de siete aislamientos de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici y un aislamiento de Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. El total de aislamientos en todas las generaciones fue de 168. Se extrajo ADN y se evaluó la presencia de los genes a través de PCR con el uso de primers específicos para cada gen. Se realizaron mapas de calor para obtener un análisis visual de datos de la expresión génica del hongo en los aislamientos. Se demostró que existe un fenómeno de presencia y ausencia de genes SIX entre generaciones, así como diferencias en morfología. Se determinó que el fenómeno está sucediendo con mayor proporción en el gen SIX1 y en menor proporción en el gen SIX3. La causa de este fenómeno de presencia y ausencia de genes SIX entre generaciones, está ligada a su ubicación en el cromosoma 14 del genoma de Fusarium oxysporum, el cual es transferido horizontalmente. Sin embargo, es recomendado secuenciar el producto de la PCR, para obtener un factor preciso que determine la causa de este fenómeno. 2020-11-27T19:50:56Z 2020-11-27T19:50:56Z 2020 Thesis https://bdigital.zamorano.edu/handle/11036/6857 spa 26 p. Copyright Escuela Agrícola Panamericana, Zamorano, 2020 http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es openAccess application/pdf application/pdf Zamorano Zamorano: Escuela Agrícola Panamericana, 2020.
institution Universidad Zamorano
collection Biblioteca Digital Zamorano
language Español
topic ADN
Genoma
Patogenicidad
Primers
Virulencia
spellingShingle ADN
Genoma
Patogenicidad
Primers
Virulencia
Bautista F., Álvaro J.
Suazo T., Andrea K.
Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
description El tomate es una de las hortalizas más importantes en el mundo, siendo afectada severamente por el hongo fitopatógeno Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. El estudio del proteoma de la savia del xilema es de vital importancia, ya que determina la presencia de los genes de avirulencia, llamados genes SIX (secretados en xilema). El objetivo de este estudio fue, evaluar la presencia de los genes SIX1 y SIX3 a través de la generación madre, primera generación y segunda generación de siete aislamientos de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici y un aislamiento de Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. El total de aislamientos en todas las generaciones fue de 168. Se extrajo ADN y se evaluó la presencia de los genes a través de PCR con el uso de primers específicos para cada gen. Se realizaron mapas de calor para obtener un análisis visual de datos de la expresión génica del hongo en los aislamientos. Se demostró que existe un fenómeno de presencia y ausencia de genes SIX entre generaciones, así como diferencias en morfología. Se determinó que el fenómeno está sucediendo con mayor proporción en el gen SIX1 y en menor proporción en el gen SIX3. La causa de este fenómeno de presencia y ausencia de genes SIX entre generaciones, está ligada a su ubicación en el cromosoma 14 del genoma de Fusarium oxysporum, el cual es transferido horizontalmente. Sin embargo, es recomendado secuenciar el producto de la PCR, para obtener un factor preciso que determine la causa de este fenómeno.
author2 Avellaneda, Carolina
author_facet Avellaneda, Carolina
Bautista F., Álvaro J.
Suazo T., Andrea K.
format Tesis
author Bautista F., Álvaro J.
Suazo T., Andrea K.
author_sort Bautista F., Álvaro J.
title Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_short Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_full Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_fullStr Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_full_unstemmed Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
title_sort evaluación de la presencia entre generaciones de los genes six (secretado en xilema) en fusarium oxysporum f. sp. lycopersici
publisher Zamorano: Escuela Agrícola Panamericana, 2020.
publishDate 2020
url https://bdigital.zamorano.edu/handle/11036/6857
work_keys_str_mv AT bautistafalvaroj evaluaciondelapresenciaentregeneracionesdelosgenessixsecretadoenxilemaenfusariumoxysporumfsplycopersici
AT suazotandreak evaluaciondelapresenciaentregeneracionesdelosgenessixsecretadoenxilemaenfusariumoxysporumfsplycopersici
_version_ 1808119508302299136