| Sumario: | Desde la década los 80's, las infecciones virales se han convertido en una de las principales enfermedades de cultivos hortícolas como el tomate, chile, melón, sandía y vegetales orientales en Honduras. Este estudio, reporta los resultados de la investigación para caracterizar los begomovirus (Familia: Geminiviridae) presentes en Honduras, identificar la presencia de otros virus no transmitidos por mosca blanca y determinar la incidencia relativa de cada tipo de virus presentes en los cultivos mencionados y en malezas. Se realizaron pruebas moleculares por PCR utilizando primeros específicos para begomovirus, desarrollados en las Universidades de Wisconsin y de Arizona, seguidos por secuenciación de productos de la amplificación para caracterizar estos virus. La secuenciación realizada en la Universidad Wisconsin identificó los siguientes begomovirus virus en tomate: Tomato severe leaf curl virus, Tomato mild motile virus y Tomato Havana virus; también se identificó un begomovirus en la maleza Rhyncosia spp.
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