Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011
Se realizó la caracterización molecular de 105 accesiones de Cacao que contemplan 79 colectas nacionales, 21 híbridos de referencia y 5 materiales criollo referencia , congregados en 8 grupos de acuerdo a su ubicación geográfica al momento de la colecta; utilizando 10 marcadores moleculares...
| Main Author: | |
|---|---|
| Format: | Tesis |
| Language: | Español |
| Published: |
2012
|
| Subjects: | |
| Online Access: | http://repositorio.una.edu.ni/2164/ http://repositorio.una.edu.ni/2164/1/tnf30h565c.pdf |
| _version_ | 1855491021465452544 |
|---|---|
| author | Herrera García, Kenia María |
| author_browse | Herrera García, Kenia María |
| author_facet | Herrera García, Kenia María |
| author_sort | Herrera García, Kenia María |
| collection | Repositorio UNA |
| description | Se
realizó
la caracterización molecular de 105 accesiones de Cacao que contemplan 79
colectas nacionales, 21 híbridos de referencia y 5 materiales criollo referencia
, congregados
en 8 grupos
de acuerdo a su ubicación geográfica al momento de la colecta;
utilizando 10
marcadores moleculares tipo SSR con el fin de conocer la divers
idad genética de Cacao
colectado
en finca de productores nicaragüenses
. Se utilizó
el método de extracción de
ADN C
TAB
-
Buffer, Amplificación de fragmentos de ADN mediante la técnica PCR
,
visualización de fragmentos de ADN en cámara electroforesis.
Se identificaron 183 alelos
en las 105 ac
cesiones con una media de 18.3,
los rangos de Heterosigocidad observada y
esperada
resultaron mayores para MTcCIR12 con 0.437 y 0.81 respectivamente
; el
CIP
y el
Índice de Shannon
proporcionaron los mayores valores para MTcCIR12 con 0.96 y 1.94
respectivamente
.
La media general del CIP e Índice de Shannon para todos los locus es de
0.87
y 1.37 respectivamente; e
l análisis molecular de varianza reveló que las diferencias
genéticas dentro de los grupos (85%) es mayor que las
diferencias entre grupos (15%)
;
se
realizó el dendograma basado en las distancia de Nei’s donde revela diferencias m
ínimas
entre los grupos
, la mayor relación genética son entre los grupos RSJ y Carazo
;
en cambio
para el grupo Carazo e Hibrido referencia se encontraron las mayores diferencias. E
n el
PCA se encontró materiales colectados que resultaron genéticamente pare
cidos a los
criollo
s
referencias, es el caso de
RSJ
0211, RSJ 0
311, RSJ 0511, Bomat0510,
Ji0210
; los
materiales Ji
-
Cuá 0104 y RSJ0411 están estrechamente relacionado
.
Se demostró
que existe
una alta diversidad genética y que existen materiales promisorios
para posteriores estudios
de mejora genética |
| format | Tesis |
| id | RepoUNA2164 |
| institution | Universidad Nacional Agraria |
| language | Español |
| publishDate | 2012 |
| publishDateSort | 2012 |
| record_format | eprints |
| spelling | RepoUNA21642014-08-12T18:47:25Z http://repositorio.una.edu.ni/2164/ Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011 Herrera García, Kenia María F30 Genética vegetal y fitomejoramiento Se realizó la caracterización molecular de 105 accesiones de Cacao que contemplan 79 colectas nacionales, 21 híbridos de referencia y 5 materiales criollo referencia , congregados en 8 grupos de acuerdo a su ubicación geográfica al momento de la colecta; utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR con el fin de conocer la divers idad genética de Cacao colectado en finca de productores nicaragüenses . Se utilizó el método de extracción de ADN C TAB - Buffer, Amplificación de fragmentos de ADN mediante la técnica PCR , visualización de fragmentos de ADN en cámara electroforesis. Se identificaron 183 alelos en las 105 ac cesiones con una media de 18.3, los rangos de Heterosigocidad observada y esperada resultaron mayores para MTcCIR12 con 0.437 y 0.81 respectivamente ; el CIP y el Índice de Shannon proporcionaron los mayores valores para MTcCIR12 con 0.96 y 1.94 respectivamente . La media general del CIP e Índice de Shannon para todos los locus es de 0.87 y 1.37 respectivamente; e l análisis molecular de varianza reveló que las diferencias genéticas dentro de los grupos (85%) es mayor que las diferencias entre grupos (15%) ; se realizó el dendograma basado en las distancia de Nei’s donde revela diferencias m ínimas entre los grupos , la mayor relación genética son entre los grupos RSJ y Carazo ; en cambio para el grupo Carazo e Hibrido referencia se encontraron las mayores diferencias. E n el PCA se encontró materiales colectados que resultaron genéticamente pare cidos a los criollo s referencias, es el caso de RSJ 0211, RSJ 0 311, RSJ 0511, Bomat0510, Ji0210 ; los materiales Ji - Cuá 0104 y RSJ0411 están estrechamente relacionado . Se demostró que existe una alta diversidad genética y que existen materiales promisorios para posteriores estudios de mejora genética 2012 Tesis NonPeerReviewed text es cc_by_nc_nd http://repositorio.una.edu.ni/2164/1/tnf30h565c.pdf Herrera García, Kenia María (2012) Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011. Ingeniería thesis, Universidad Nacional Agraria, UNA. |
| spellingShingle | F30 Genética vegetal y fitomejoramiento Herrera García, Kenia María Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011 |
| title | Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011 |
| title_full | Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011 |
| title_fullStr | Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011 |
| title_full_unstemmed | Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011 |
| title_short | Caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(Theobroma Cacao L.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR en INTA-CNIAB, Nicaragua, 2011 |
| title_sort | caracterización molecular de 105 accesiones de cacao(theobroma cacao l.) utilizando 10 marcadores moleculares tipo ssr en inta-cniab, nicaragua, 2011 |
| topic | F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
| url | http://repositorio.una.edu.ni/2164/ http://repositorio.una.edu.ni/2164/1/tnf30h565c.pdf |