Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle
In Swedish beef retail cuts there are marked differences in meat quality, e.g. tenderness and marbling, between individual animals. A proportion of these differences are explained by the animals' genetic make up. A number of polymorphisms in key genes have been reported for their association with me...
| Autor principal: | |
|---|---|
| Formato: | L3 |
| Lenguaje: | Inglés sueco |
| Publicado: |
SLU/Dept. of Animal Breeding and Genetics (until 231231)
2008
|
| Materias: |
| _version_ | 1855571819665293312 |
|---|---|
| author | Leveau, Carina |
| author_browse | Leveau, Carina |
| author_facet | Leveau, Carina |
| author_sort | Leveau, Carina |
| collection | Epsilon Archive for Student Projects |
| description | In Swedish beef retail cuts there are marked differences in meat quality, e.g. tenderness and marbling, between individual animals. A proportion of these differences are explained by the animals' genetic make up. A number of polymorphisms in key genes have been reported for their association with meat quality traits and the major candidate genes in this paper are DGAT1, Leptin, TG, CAPN1, CAST, and DNAJA1. Genotype information on 400 individuals from five Swedish beef breeds (Charolais, Hereford, Angus, Simmental and Limousin) regarding eight polymorphisms located in four candidate genes was compared to literature reports. The results from frequency analyses of these eight polymorphisms revealed only minor deviations from previous reports. However, the Simmental individuals in this study differed from both the other Bos Taurus breeds included in the study and from results in the literature in that a lower frequency of the "tender" T allele was observed for the marker CAPN1-4571 in the gene encoding the proteolytic enzyme calpain. This could be a result of "sampling effect" due to small sample size i.e. the samples are not representative for the overall population.
In an upcoming study regarding genetic effects on meat quality in Swedish beef breeds samples from pure beef breeds need to be complemented with crossbreeds in order to achieve adequate sample sizes. Systematic effects of gender, feed, age, and slaughter treatment should be minimized, especially considered the limited animal material available. Potential breeding animals may, when associations between the candidate genes and meat quality traits are well established, be genotyped to add information about their genetic potential for producing high quality beef. |
| format | L3 |
| id | RepoSLU11165 |
| institution | Swedish University of Agricultural Sciences |
| language | Inglés swe |
| publishDate | 2008 |
| publishDateSort | 2008 |
| publisher | SLU/Dept. of Animal Breeding and Genetics (until 231231) |
| publisherStr | SLU/Dept. of Animal Breeding and Genetics (until 231231) |
| record_format | eprints |
| spelling | RepoSLU111652017-09-26T11:14:08Z Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle Leveau, Carina meat quality beef leptin calpain calpastatin och diacylglycerol O-acyltransferase In Swedish beef retail cuts there are marked differences in meat quality, e.g. tenderness and marbling, between individual animals. A proportion of these differences are explained by the animals' genetic make up. A number of polymorphisms in key genes have been reported for their association with meat quality traits and the major candidate genes in this paper are DGAT1, Leptin, TG, CAPN1, CAST, and DNAJA1. Genotype information on 400 individuals from five Swedish beef breeds (Charolais, Hereford, Angus, Simmental and Limousin) regarding eight polymorphisms located in four candidate genes was compared to literature reports. The results from frequency analyses of these eight polymorphisms revealed only minor deviations from previous reports. However, the Simmental individuals in this study differed from both the other Bos Taurus breeds included in the study and from results in the literature in that a lower frequency of the "tender" T allele was observed for the marker CAPN1-4571 in the gene encoding the proteolytic enzyme calpain. This could be a result of "sampling effect" due to small sample size i.e. the samples are not representative for the overall population. In an upcoming study regarding genetic effects on meat quality in Swedish beef breeds samples from pure beef breeds need to be complemented with crossbreeds in order to achieve adequate sample sizes. Systematic effects of gender, feed, age, and slaughter treatment should be minimized, especially considered the limited animal material available. Potential breeding animals may, when associations between the candidate genes and meat quality traits are well established, be genotyped to add information about their genetic potential for producing high quality beef. Det råder idag stor variation i köttkvalitet mellan enskilda djur vilket avspeglas i en ojämn kvalitet i butikernas styckningsdetaljer. Konsumenten kan inte garanteras en god ätkvalitet, vilket kan leda till minskad förtroende för svenskt kött och därmed påverka efterfrågan. Köttkvaliteten är därför av ekonomiskt betydelse för den svenska nötköttsproduktionen. Köttkvaliteten styrs av djurets genuppsättning i kombination med miljöpåverkan som t.ex. foder och slakthantering. Resultat från internationella forskargrupper pekar på betydande inflytande av enskilda gener på mörhet och andra egenskaper som är av betydelse för ätkvaliteten. Dessa geners effekter bör även skattas för svenska produktionsförhållanden för att i framtiden bl.a. kunna utnyttjas i avelsprogram för förbättrad ätkvalitet hos svenskt kött i kombination med bra produktionsegenskaper hos de köttproducerande djuren. Litteraturstudien i detta arbete omfattar framförallt gener som påverkar mörhet och marmorering. De gener som är undersökta för sin eventuella inblandning i marmoreringsprocessen är främst de som kodar för enzymer med direkt effekt på fettmetabolismen; leptin, thyroglobulin och DGAT (acyl-CoA: diacylglycerol acyltransferas). Samtliga dessa gener innehåller en eller flera enskilda mutationer som i olika studier visat sig påverka fettrelaterade egenskaper. Vad gäller köttets mörhet är de gener som styr uttrycket av det proteolytiska enzymet calpain och dess inhibitor calpastatin av särskilt intresse. Även dessa gener innehåller en rad mutationer som anses inverka på slutproduktens kvalitet. Litteraturstudien omfattar förutom ovan nämnda gener även gener vilkas effekter endast analyserats i ett fåtal studier, t.ex. DNAJA1 (ett s.k. heat shock protein) och NAT1 (Novel APOBEC-1 target-1). Studien inkluderar en analys av allelfrekvenser för några mutationer i de mest undersökta kandidatgenerna. Totalt har ca 400 köttdjur genotypbestämts av det engelska företaget Igenity. De genotypade djuren härrör från svenska besättningar och representerar de fem olika raserna Charolais, Angus, Hereford, Limousin och Simmental. Allelfrekvenserna för de olika mutationerna i kandidatgenerna är i huvudsak överrensstämmande med värden i tillgänglig litteratur. Den största rasskillnaden i allelfrekvens i vår studie observerade för markören CAPN1-4751 i genen som kodar för det proteolytiska enzymet calpain. Den ur mörhetssynpunkt ofördelaktiga T allelen (vanligt förekommande i Bos indicus raser) hade i vår undersökning en högre frekvens i rasen Simmental såväl jämfört med de övriga undersökta raserna, som de värden som anges för rasen i tillgänglig litteratur. Den högre allelfrekvensen kan möjligen hänföras till ”sampling effekter” på grund av det begränsade djurmaterialet, dvs. att de genotypade djuren inte är representativa för populationen som helhet. Vid fortsatta studier av enskilda geners effekt på köttkvalitet i den svenska populationen av köttrasdjur krävs noggrann planering vad gäller logistiken vid provinsamling och vid valet av testparametrar. På grund av den låga andelen renrasiga köttrasdjur som slaktas i Sverige är man hänvisad till att genomföra studier av köttkvalitet på korsningsdjur. För att kunna ta hänsyn till variationsorsaker som slakteri, foderstat, kön och ålder vid analysen av data, bör dessa inte tillåtas variera allt för mycket, särskilt om man arbetar med ett begränsat djurmaterial. Data från enstaka, stora gårdar med jämn fördelad slakt över säsongen är att föredra. När effekterna av de utvalda kandidatgenerna har skattats i den svenska populationen av köttrasdjur bör allelfrekvenserna i dessa gener bestämmas i de renrasiga populationerna. SLU/Dept. of Animal Breeding and Genetics (until 231231) 2008 L3 eng swe https://stud.epsilon.slu.se/11165/ |
| spellingShingle | meat quality beef leptin calpain calpastatin och diacylglycerol O-acyltransferase Leveau, Carina Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle |
| title | Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle |
| title_full | Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle |
| title_fullStr | Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle |
| title_full_unstemmed | Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle |
| title_short | Candidate genes for beef quality : allele frequencies in Swedish beef cattle |
| title_sort | candidate genes for beef quality : allele frequencies in swedish beef cattle |
| topic | meat quality beef leptin calpain calpastatin och diacylglycerol O-acyltransferase |