Linkage mapping of phenotypic markers and marker identification in MHC in a cross between red junglefowl and Obese strain chicken
Målet med detta projekt var att i en korsning mellan röd djungelhöna och Obese strain höna kartlägga, med kopplingsanalys, de fenotypiska markörerna fjäderdräktsfärg, fjädermönster och benfärg samt att identifiera en informativ markör i major histocompatibility complex (MHC). Den röda djungelhöna...
| Autor principal: | |
|---|---|
| Formato: | L3 |
| Lenguaje: | Inglés sueco |
| Publicado: |
SLU/Dept. of Animal Breeding and Genetics (until 231231)
2007
|
| Materias: |
| Sumario: | Målet med detta projekt var att i en korsning mellan röd djungelhöna och Obese strain
höna kartlägga, med kopplingsanalys, de fenotypiska markörerna fjäderdräktsfärg,
fjädermönster och benfärg samt att identifiera en informativ markör i major
histocompatibility complex (MHC). Den röda djungelhönan anses vara anfadern till
dagens domesticerade höna och Obese strain hönan utvecklar spontan autoimmun tyroidit
och är modelldjur för den humana sjukdomen Hashimotos tyroidit. De aktuella lokusen
involverade i de fenotypiska markörerna är Dominant vit (I)/PMEL17, Gula ben (W),
Inhibering av dermalt melanin (Id), Extension (E)/MC1R, Barring (B) och Stippling. W
lokus kartlades till kromosom 24, I lokus till kopplingsgrupp E22C19W28 och Id lokus
16
och B lokus båda till kromosom Z. Kartläggningen av W, I, Id och B stämmer överens
med tidigare resultat men E lokus och Stippling kunde inte kartläggas. Det finns fler
lokus som påverkar färg på fjädrar och ben. Dessa lokus tillsammans med
geninteraktioner kan ha bidragit till att E inte kunde kartläggas. Den genomsnittliga
kartlängden i denna korsning är 2358.85 cM med ett genomsnittligt marköravstånd av
6.63 cM och den hanliga kartan är 7.3% längre än den honliga. Sex enkel nukleotid
variationer hittades i start- och slutsekvenserna av kromosom 16 men analyserades inte
vidare.
För att kunna studera relationen mellan MHC och spontan autoimmun tyroidit så
behövs det en eller flera markörer i MHC. Mikrosatellitmarkören LEI0258 testades och
visade sig vara informativ i korsningen. Fortsatta studier kommer att undersöka om
tidigare nämnda MHC haplotyper är kopplade till svår (B13 och B15) eller lindrig (B5)
sjukdom. |
|---|