La secuenciación masiva en el diagnóstico de virus de cultivos leñosos

Las tecnologías de secuenciación masiva, también conocidas como NGS o HTS (Next-Generation Sequencing, High-Throughput Sequencing), tienen varias ventajas sobre los enfoques biológicos, serológicos y moleculares tradicionales, tanto para el diagnóstico de enfermedades como para la detección de virus...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores principales: Ruiz-García, Ana B., Olmos, Antonio
Formato: contributionToPeriodical
Lenguaje:Español
Publicado: Sociedad Española de Fitopatología (SEF) 2022
Materias:
Acceso en línea:http://hdl.handle.net/20.500.11939/8140
https://sef.es/sites/default/files/publications/fitopatologia06_0.pdf#page=6
Descripción
Sumario:Las tecnologías de secuenciación masiva, también conocidas como NGS o HTS (Next-Generation Sequencing, High-Throughput Sequencing), tienen varias ventajas sobre los enfoques biológicos, serológicos y moleculares tradicionales, tanto para el diagnóstico de enfermedades como para la detección de virus específicos en plantas leñosas. Entre las ventajas más importantes está que esta técnica no requiere un conocimiento a priori sobre los virus que infectan la planta. Esto significa que no es necesario conocer la secuencia genómica de un virus para poder ser detectado, a diferencia de las técnicas de amplificación basadas en la PCR o isotermas, cuyo requisito es el conocimiento de la secuencia genética a detectar para diseñar cebadores o sondas. También presenta ventajas sobre las técnicas ELISA, que se restringen a la detección de virus para los que haya disponibilidad de anticuerpos para el diagnóstico serológico. Estas dos formas de detección, las moleculares y las serológicas tradicionales, son muy específicas y, por tanto, no pueden identificar virus desconocidos o posibles variantes muy divergentes que podrían estar involucrados en la etiología de una enfermedad.