Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr
Genetic variability can be generated through in vitro culture via somaclonal variation. This tool can be potentially useful in a breeding program involving apomictic buffelgrass genotypes. The aim of this work was to evaluate inter simple sequence repeats (ISSR) as molecular markers to detect geneti...
| Autores principales: | , , , , , , |
|---|---|
| Formato: | Artículo |
| Lenguaje: | Inglés |
| Publicado: |
Universidad Nacional de Cuyo
2018
|
| Materias: | |
| Acceso en línea: | http://revista.fca.uncu.edu.ar/images/stories/pdfs/2018-02/Cp_01_Carloni.pdf http://hdl.handle.net/20.500.12123/4087 |
| _version_ | 1855483362264743936 |
|---|---|
| author | Carloni, Edgardo José Lopez Colomba, Eliana Ribotta, Andrea Noemi Quiroga, Mariana Paola Tommasino, Exequiel Arturo Griffa, Sabrina Mariana Grunberg, Karina |
| author_browse | Carloni, Edgardo José Griffa, Sabrina Mariana Grunberg, Karina Lopez Colomba, Eliana Quiroga, Mariana Paola Ribotta, Andrea Noemi Tommasino, Exequiel Arturo |
| author_facet | Carloni, Edgardo José Lopez Colomba, Eliana Ribotta, Andrea Noemi Quiroga, Mariana Paola Tommasino, Exequiel Arturo Griffa, Sabrina Mariana Grunberg, Karina |
| author_sort | Carloni, Edgardo José |
| collection | INTA Digital |
| description | Genetic variability can be generated through in vitro culture via somaclonal variation. This tool can be potentially useful in a breeding program involving apomictic buffelgrass genotypes. The aim of this work was to evaluate inter simple sequence repeats (ISSR) as molecular markers to detect genetic variation in in vitro buffelgrass regenerated plants. Six plants regenerated from in vitro anther culture, via somatic embryogenesis were used, as well as the anther donor genotype (RN 51) as control. Of a total of 26 ISSR primers tested, 22 amplified, detecting 12% polymorphism with a divergence between 5 and 24% from RN 51. Amplification products were observed with the primers containing di-, tri- or tetra-nucleotide sequences, with or without additional nucleotides at the 3′ end. The most informative primers were those containing the repetitive sequences GACAn, AGn or GAn. Moreover, the regenerants transplanted at field conditions differed in morphological characteristics among them and with respect to RN 51. This study confirms that ISSR are useful to identify genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants. |
| format | Artículo |
| id | INTA4087 |
| institution | Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA -Argentina) |
| language | Inglés |
| publishDate | 2018 |
| publishDateRange | 2018 |
| publishDateSort | 2018 |
| publisher | Universidad Nacional de Cuyo |
| publisherStr | Universidad Nacional de Cuyo |
| record_format | dspace |
| spelling | INTA40872018-12-14T13:33:57Z Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr Carloni, Edgardo José Lopez Colomba, Eliana Ribotta, Andrea Noemi Quiroga, Mariana Paola Tommasino, Exequiel Arturo Griffa, Sabrina Mariana Grunberg, Karina Cenchrus Ciliaris Variación Genética Pastizales Marcadores Genéticos Embriogénesis Somática Experimentación in Vitro Genetic Variation Grasses Genetic Markers Somatic Embryogenesis In Vitro Experimentation Buffel Grass Marcadores Moleculares Marcadores ISSR Genetic variability can be generated through in vitro culture via somaclonal variation. This tool can be potentially useful in a breeding program involving apomictic buffelgrass genotypes. The aim of this work was to evaluate inter simple sequence repeats (ISSR) as molecular markers to detect genetic variation in in vitro buffelgrass regenerated plants. Six plants regenerated from in vitro anther culture, via somatic embryogenesis were used, as well as the anther donor genotype (RN 51) as control. Of a total of 26 ISSR primers tested, 22 amplified, detecting 12% polymorphism with a divergence between 5 and 24% from RN 51. Amplification products were observed with the primers containing di-, tri- or tetra-nucleotide sequences, with or without additional nucleotides at the 3′ end. The most informative primers were those containing the repetitive sequences GACAn, AGn or GAn. Moreover, the regenerants transplanted at field conditions differed in morphological characteristics among them and with respect to RN 51. This study confirms that ISSR are useful to identify genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants. El cultivo in vitro permite generar variabilidad genética mediante variación somaclonal. Este fenómeno puede ser potencialmente útil en un programa de mejora en genotipos apomícticos de buffelgrass. El objetivo del presente estudio fue evaluar inter secuencias simples repetidas (ISSR) como marcadores moleculares en la detección de variación genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass. Se utilizaron seis plantas regeneradas mediante el cultivo in vitro de anteras, vía embriogénesis somática, y el genotipo dador de anteras (NR 51) como control. De un total de 26 cebadores ISSR probados, 22 de ellos amplificaron, detectando un 12% de polimorfismo con una divergencia del 5 al 24% con respecto al material NR 51. Se observaron productos de amplificación con los cebadores que contienen secuencias di-, tri- o tetra-nucleótidos, con o sin nucleótidos adicionales en el extremo 3′. Los cebadores más informativos fueron aquellos que contenían secuencias repetitivas GACAn, AGn o GAn. Conjuntamente, las plantas trasplantadas a campo manifestaron características morfológicas diferentes entre ellas y con respecto al NR 51. El presente estudio confirma que el empleo de ISSR permite identificar variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass. Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales Fil: Carloni, Edgardo José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina Fil: Lopez Colomba, Eliana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina Fil: Ribotta, Andrea Noemi. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina Fil: Quiroga, Mariana Paola. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina Fil: Tommasino, Exequiel Arturo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina Fil: Griffa, Sabrina Mariana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina Fil: Grunberg, Karina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Fisiología y Recursos Genéticos Vegetales; Argentina. Consejo de Nacional Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina 2018-12-14T13:31:15Z 2018-12-14T13:31:15Z 2018 info:ar-repo/semantics/artículo info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://revista.fca.uncu.edu.ar/images/stories/pdfs/2018-02/Cp_01_Carloni.pdf http://hdl.handle.net/20.500.12123/4087 0370-4661 1853-8665 eng info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) application/pdf Universidad Nacional de Cuyo Revista de la Facultad de Ciencias Agrarias / Universidad Nacional de Cuyo 50 (2) : 1-13 (2018) |
| spellingShingle | Cenchrus Ciliaris Variación Genética Pastizales Marcadores Genéticos Embriogénesis Somática Experimentación in Vitro Genetic Variation Grasses Genetic Markers Somatic Embryogenesis In Vitro Experimentation Buffel Grass Marcadores Moleculares Marcadores ISSR Carloni, Edgardo José Lopez Colomba, Eliana Ribotta, Andrea Noemi Quiroga, Mariana Paola Tommasino, Exequiel Arturo Griffa, Sabrina Mariana Grunberg, Karina Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr |
| title | Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr |
| title_full | Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr |
| title_fullStr | Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr |
| title_full_unstemmed | Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr |
| title_short | Analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers = Análisis de variabilidad genética en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr |
| title_sort | analysis of genetic variability in in vitro regenerated buffelgrass plants through issr molecular markers analisis de variabilidad genetica en plantas regeneradas in vitro de buffelgrass mediante marcadores moleculares issr |
| topic | Cenchrus Ciliaris Variación Genética Pastizales Marcadores Genéticos Embriogénesis Somática Experimentación in Vitro Genetic Variation Grasses Genetic Markers Somatic Embryogenesis In Vitro Experimentation Buffel Grass Marcadores Moleculares Marcadores ISSR |
| url | http://revista.fca.uncu.edu.ar/images/stories/pdfs/2018-02/Cp_01_Carloni.pdf http://hdl.handle.net/20.500.12123/4087 |
| work_keys_str_mv | AT carloniedgardojose analysisofgeneticvariabilityininvitroregeneratedbuffelgrassplantsthroughissrmolecularmarkersanalisisdevariabilidadgeneticaenplantasregeneradasinvitrodebuffelgrassmediantemarcadoresmolecularesissr AT lopezcolombaeliana analysisofgeneticvariabilityininvitroregeneratedbuffelgrassplantsthroughissrmolecularmarkersanalisisdevariabilidadgeneticaenplantasregeneradasinvitrodebuffelgrassmediantemarcadoresmolecularesissr AT ribottaandreanoemi analysisofgeneticvariabilityininvitroregeneratedbuffelgrassplantsthroughissrmolecularmarkersanalisisdevariabilidadgeneticaenplantasregeneradasinvitrodebuffelgrassmediantemarcadoresmolecularesissr AT quirogamarianapaola analysisofgeneticvariabilityininvitroregeneratedbuffelgrassplantsthroughissrmolecularmarkersanalisisdevariabilidadgeneticaenplantasregeneradasinvitrodebuffelgrassmediantemarcadoresmolecularesissr AT tommasinoexequielarturo analysisofgeneticvariabilityininvitroregeneratedbuffelgrassplantsthroughissrmolecularmarkersanalisisdevariabilidadgeneticaenplantasregeneradasinvitrodebuffelgrassmediantemarcadoresmolecularesissr AT griffasabrinamariana analysisofgeneticvariabilityininvitroregeneratedbuffelgrassplantsthroughissrmolecularmarkersanalisisdevariabilidadgeneticaenplantasregeneradasinvitrodebuffelgrassmediantemarcadoresmolecularesissr AT grunbergkarina analysisofgeneticvariabilityininvitroregeneratedbuffelgrassplantsthroughissrmolecularmarkersanalisisdevariabilidadgeneticaenplantasregeneradasinvitrodebuffelgrassmediantemarcadoresmolecularesissr |