Estudio de la arquitectura genética del duraznero a través de la identificación de loci de caracteres cuantitativos utilizando análisis de genoma completo para múltiples caracteres agronómicos

Poster

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Main Authors: Chirino, Julian Santiago, Aballay, Maximiliano Martín, Valentini, Gabriel Hugo, Sanchez, Gerardo
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Published: REDBIO Argentina 2023
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spelling INTA147402023-07-13T11:39:22Z Estudio de la arquitectura genética del duraznero a través de la identificación de loci de caracteres cuantitativos utilizando análisis de genoma completo para múltiples caracteres agronómicos Chirino, Julian Santiago Aballay, Maximiliano Martín Valentini, Gabriel Hugo Sanchez, Gerardo Prunus persica Frutales Durazno Loci de Rasgos Cuantitativos Fitomejoramiento Fisiología Postcosecha Fenología Biotecnología Fruit Crops Peaches Quantitative Trait Loci Plant Breeding Phenology Biotechnology Postharvest Physiology QTL Poster La disminución en los costos de secuenciación (Next Generation Sequencing) desplegó un amplio abanico de posibilidades en estudios genómicos. La identificación de marcadores moleculares (MM) asociados a caracteres de herencia simple y compleja (QTL) se posicionó como una herramienta de gran potencialidad, en programas de mejoramiento de especies perennes, tales como el duraznero (Prunus persica (L) Stokes). El objetivo de este estudio consistió en determinar el control genético de múltiples caracteres de importancia agronómica. La EEA San Pedro cuenta con un panel de 237 accesiones que integran el banco activo de germoplasma (BAG) genotipificadas bajo la metodología ddRAD-seq con 14057 MM identificados entre SNP, SSR e InDel. Durante las campañas 2021/2022 y 2022/2023, se utilizaron diversas metodologías de fenotipificado (observacionales y experimentales) para medir las variables: Tipo de fruto (durazno/nectarina), Color de pulpa (amarillo/blanco, L, a, b, c y HUE), Tipo de pulpa (melting/no melting), Acidez (ácido/subácido), Frutos deantociánicos (con/sin coloración), Densidad de flores (flores/cm), Tipo de flor (rosácea/campanulácea). Además, se midieron caracteres fenológicos: Endodormancia (días, horas de frío, unidades de frío y porciones de frío), Ecodormancia (días, Growing Degree Hours (GDH)), floración (días), período de desarrollo del fruto (días, GDH), Fecha de cosecha (días, GDH) y caracteres asociados a daños por frío en postcosecha: Conservación refrigerada (47 días), Harinosidad (presencia/ausencia (P/A)), Pardeamiento (P/A) y Sangrado (P/A). Para determinar la existencia de control genético y su ubicación, se realizaron análisis de asociación del genoma completo (GWAS) y estadísticos en software R. Se consideró asociación significativa con LOD> 5,44. Como resultado se determinaron los siguientes QTL: Tipo de fruto (cromosoma (chr): 5, LOD= 10,26); Color de pulpa (chr: 1, LOD= 12,96); Tipo de pulpa (chr: 3, LOD= 8,50); Acidez (chr: 5, LOD= 17,39); Frutos deantociánicos (chr: 3, LOD= 9,04); Densidad de flores (Chr: 6 , LOD= 5,44); Tipo de flor (chr: 2 , LOD= 11); Los QTL de Endodormancia, Ecodormancia y Floración se presentaron colocalizados (chr: 1, LOD= 15,4; chr: 4, LOD= 10,4 y LOD= 11.94); Período de desarrollo del fruto y Cosecha (chr: 4, LOD= 10.67; chr: 6, LOD= 8.05); Conservación refrigerada y Harinosidad (chr: 2, LOD= 11.61); Pardeamiento (chr: 2, LOD= 6,45); Sangrado (chr: 4, LOD= 6.1). Este estudio aporta información relevante para el conocimiento de la arquitectura genética del duraznero y el diseño de programas de mejoramiento que llevaran a una disminución en el uso de recursos y una mayor eficacia para la obtención de variedades. EEA San Pedro Fil: Chirino, Julián Santiago. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Pedro; Argentina Fil: Aballay, Maximiliano Martín. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Pedro; Argentina Fil: Valentini, Gabriel Hugo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Pedro; Argentina Fil: Sánchez, Gerardo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria San Pedro; Argentina 2023-07-13T11:27:14Z 2023-07-13T11:27:14Z 2023-06 info:ar-repo/semantics/documento de conferencia info:eu-repo/semantics/conferenceObject info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://hdl.handle.net/20.500.12123/14740 spa info:eu-repograntAgreement/INTA/2023-PE-L01-I105/2023-PE-L01-I105, Generación de conocimientos, tecnologías e innovaciones para una fruticultura sostenible adaptadas al riesgo ambiental y a la mecanización info:eu-repograntAgreement/INTA/2019-PE-E6-I114-001/2019-PE-E6-I114-001, Caracterización de la diversidad genética de plantas, animales y microorganismos mediante herramientas de genómica aplicada. info:eu-repograntAgreement/INTA/2023-PD-L01-I087/2023-PD-L01-I087, Caracterización de la diversidad genética de plantas, animales y microorganismos mediante herramientas de genómica aplicada. info:eu-repograntAgreement/INTA/2019-PE-E6-I125-001/2019-PE-E6-I125-001, Mejoramiento genético, caracterización y uso de variabilidad con aplicación de herramientas biotecnológicas en cultivos frutales info:eu-repo/semantics/restrictedAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) application/pdf REDBIO Argentina XIV Simposio REDBIO Argentina. Biotecnología para un mundo en cambio. Ciudad Autónoma de Buenos Aires. 28 al 30 de junio 2023.
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