Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)

Objetivo: Determinar la variabilidad genética y evaluar la utilidad de microsatélites (STR) en la determinación de paternidad en alpacas blancas huacaya, pertenecientes al Centro Piloto de Mejoramiento Genético Munay Paqocha y el Fundo Itita, de la Sociedad Peruana de Criadores de Alpacas y Llamas (...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: Yalta Macedo, Claudia Esther, Sotil, Giovanna, Veli Rivera, Eudosio A.
Format: info:eu-repo/semantics/article
Language:Español
Published: Universidad Peruana Cayetano Heredia 2022
Subjects:
Online Access:https://hdl.handle.net/20.500.12955/1855
https://doi.org/10.20453/stv.v2i2.2253
_version_ 1855028619476205568
author Yalta Macedo, Claudia Esther
Sotil, Giovanna
Veli Rivera, Eudosio A.
author_browse Sotil, Giovanna
Veli Rivera, Eudosio A.
Yalta Macedo, Claudia Esther
author_facet Yalta Macedo, Claudia Esther
Sotil, Giovanna
Veli Rivera, Eudosio A.
author_sort Yalta Macedo, Claudia Esther
collection Repositorio INIA
description Objetivo: Determinar la variabilidad genética y evaluar la utilidad de microsatélites (STR) en la determinación de paternidad en alpacas blancas huacaya, pertenecientes al Centro Piloto de Mejoramiento Genético Munay Paqocha y el Fundo Itita, de la Sociedad Peruana de Criadores de Alpacas y Llamas (SPAR) Puno. Realizar la genotipificación y selección de marcadores STR útiles para la asignación de paternidad y parentesco. Metodología: Se evaluaron 10 marcadores STR a partir de ADN aislado de sangre y de folículos pilosos de 183 individuos colectados al azar procedentes de dos rebaños. Resultados y Conclusiones: Se observó un alto nivel de variabilidad alélica en el total de individuos analizados, y la presencia de alelos exclusivos entre poblaciones, con frecuencias menores al 1,5% en los loci LCA37, LCA90, LCA5, VOLP92, YWLL36, YWLL44 y YWLL08. Se propone la incorporación de tres marcadores adicionales, VOLP92, LCA94 y LCA90 para los análisis de variabilidad genética en alpacas. Los valores de FIS (0,016), y FST (0,003) reflejaron bajo niveles de endogamia. El rebaño del Fundo Itita presentó una mayor Ho (0,858) respecto a la He (0,848), mientras que por el contrario el rebaño del Centro Munay Paqocha presentó un menor valor de la Ho (0,815) respecto a la He (0,848), con una tendencia al déficit de heterocigotos. Los 10 marcadores presentaron una probabilidad de exclusión de parentesco adecuada, con un valor superior al 99,9%, cuando se conoce el genotipo de ambos padres, y un poder de discriminación mayor a 0,90. Además, se alcanzó un valor PEC de 0,999 considerando solo los marcadores YWLL08, YWLL44, LCA37, YWLL36, LCA8; siendo YWLL08 el de mayor valor (0,885). La prueba de filiación permitió detectar mayores errores de asignación de maternidad (13,04%) y paternidad (30,4%) en el rebaño del Fundo Itita, en comparación a Munay Paqocha con errores de designación de maternidad de 7,69% y de paternidad de 17,95%, concluyendo que este centro posee un mejor registro de empadres.
format info:eu-repo/semantics/article
id INIA1855
institution Institucional Nacional de Innovación Agraria
language Español
publishDate 2022
publishDateRange 2022
publishDateSort 2022
publisher Universidad Peruana Cayetano Heredia
publisherStr Universidad Peruana Cayetano Heredia
record_format dspace
spelling INIA18552022-11-21T19:57:12Z Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos) Genetic variability of Peruvian Alpacas (Vicugna pacos) by using microsatellite markers Yalta Macedo, Claudia Esther Sotil, Giovanna Veli Rivera, Eudosio A. Camélidos sudamericanos Heterocigosidad Coeficiente de endogamia Probabilidad de exclusión STR https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02 Objetivo: Determinar la variabilidad genética y evaluar la utilidad de microsatélites (STR) en la determinación de paternidad en alpacas blancas huacaya, pertenecientes al Centro Piloto de Mejoramiento Genético Munay Paqocha y el Fundo Itita, de la Sociedad Peruana de Criadores de Alpacas y Llamas (SPAR) Puno. Realizar la genotipificación y selección de marcadores STR útiles para la asignación de paternidad y parentesco. Metodología: Se evaluaron 10 marcadores STR a partir de ADN aislado de sangre y de folículos pilosos de 183 individuos colectados al azar procedentes de dos rebaños. Resultados y Conclusiones: Se observó un alto nivel de variabilidad alélica en el total de individuos analizados, y la presencia de alelos exclusivos entre poblaciones, con frecuencias menores al 1,5% en los loci LCA37, LCA90, LCA5, VOLP92, YWLL36, YWLL44 y YWLL08. Se propone la incorporación de tres marcadores adicionales, VOLP92, LCA94 y LCA90 para los análisis de variabilidad genética en alpacas. Los valores de FIS (0,016), y FST (0,003) reflejaron bajo niveles de endogamia. El rebaño del Fundo Itita presentó una mayor Ho (0,858) respecto a la He (0,848), mientras que por el contrario el rebaño del Centro Munay Paqocha presentó un menor valor de la Ho (0,815) respecto a la He (0,848), con una tendencia al déficit de heterocigotos. Los 10 marcadores presentaron una probabilidad de exclusión de parentesco adecuada, con un valor superior al 99,9%, cuando se conoce el genotipo de ambos padres, y un poder de discriminación mayor a 0,90. Además, se alcanzó un valor PEC de 0,999 considerando solo los marcadores YWLL08, YWLL44, LCA37, YWLL36, LCA8; siendo YWLL08 el de mayor valor (0,885). La prueba de filiación permitió detectar mayores errores de asignación de maternidad (13,04%) y paternidad (30,4%) en el rebaño del Fundo Itita, en comparación a Munay Paqocha con errores de designación de maternidad de 7,69% y de paternidad de 17,95%, concluyendo que este centro posee un mejor registro de empadres. Resumen. Abstract. Introducción. Materiales y métodos. Resultados. Discusión. Conclusiones. Referencias bibliográficas. 2022-09-05T17:01:45Z 2022-09-05T17:01:45Z 2015-02-16 info:eu-repo/semantics/article Yalta, C., Sotil, G., & Veli, E. (2015). Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos). Salud y Tecnología Veterinaria, 2(2), 134-145. doi: 10.20453/stv.v2i2.2253 https://hdl.handle.net/20.500.12955/1855 Salud y Tecnología Veterinaria https://doi.org/10.20453/stv.v2i2.2253 spa https://doi.org/10.20453/stv.v2i2.2253 info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ application/pdf application/pdf Perú Universidad Peruana Cayetano Heredia Perú Instituto Nacional de Innovación Agraria Repositorio Institucional - INIA
spellingShingle Camélidos sudamericanos
Heterocigosidad
Coeficiente de endogamia
Probabilidad de exclusión
STR
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02
Yalta Macedo, Claudia Esther
Sotil, Giovanna
Veli Rivera, Eudosio A.
Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)
title Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)
title_full Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)
title_fullStr Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)
title_full_unstemmed Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)
title_short Variabilidad genética y detección de error en filiación utilizando microsatélites en dos rebaños de alpacas Huacaya (Vicugna pacos)
title_sort variabilidad genetica y deteccion de error en filiacion utilizando microsatelites en dos rebanos de alpacas huacaya vicugna pacos
topic Camélidos sudamericanos
Heterocigosidad
Coeficiente de endogamia
Probabilidad de exclusión
STR
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.04.02
url https://hdl.handle.net/20.500.12955/1855
https://doi.org/10.20453/stv.v2i2.2253
work_keys_str_mv AT yaltamacedoclaudiaesther variabilidadgeneticaydetecciondeerrorenfiliacionutilizandomicrosatelitesendosrebanosdealpacashuacayavicugnapacos
AT sotilgiovanna variabilidadgeneticaydetecciondeerrorenfiliacionutilizandomicrosatelitesendosrebanosdealpacashuacayavicugnapacos
AT veliriveraeudosioa variabilidadgeneticaydetecciondeerrorenfiliacionutilizandomicrosatelitesendosrebanosdealpacashuacayavicugnapacos
AT yaltamacedoclaudiaesther geneticvariabilityofperuvianalpacasvicugnapacosbyusingmicrosatellitemarkers
AT sotilgiovanna geneticvariabilityofperuvianalpacasvicugnapacosbyusingmicrosatellitemarkers
AT veliriveraeudosioa geneticvariabilityofperuvianalpacasvicugnapacosbyusingmicrosatellitemarkers