Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019
Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019,...
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| Format: | article |
| Language: | Español |
| Published: |
Pan American Health Organization
2024
|
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| Online Access: | https://iris.paho.org/handle/10665.2/52679 http://hdl.handle.net/20.500.12324/39670 https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 |
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RepoAGROSAVIA39670 |
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Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria |
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Repositorio AGROSAVIA |
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Español |
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Investigación agropecuaria - A50 Streptococcus faecalis Farmacología Ganadería y especies menores http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_16605 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5760 |
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Investigación agropecuaria - A50 Streptococcus faecalis Farmacología Ganadería y especies menores http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_16605 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5760 Saavedra, Sandra Yamile Bernal, Johan Fabian Montilla Escudero, Efrain Torres, German Rodríguez, Mabel Karina Hidalgo, Andrea Melissa Ovalle, María Victoria Rivera, Sandra Perez Gutierrez, Enrique Duarte, Carolina Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 |
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Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores
de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto
Nacional de Salud de Colombia.
Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes
al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración
inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La
diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab®. Se seleccionaron seis
aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo.
Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia.
Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256μg/mL. La tipificación por Diversilab®
indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del
genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfrG además de optrA
y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos
y tres variantes de optrA: ST16 (optrA-2), ST476 (optrA-5) y ST618 (optrA-6). El entorno genético de los aislamientos
optrA-2 (ST16) presentó el segmento impB, fex, optrA, asociado a plásmido, mientras que en dos
aislamientos (optrA-6 y optrA-5) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn6674-like.
Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optrA presentan una alta diversidad genética, con diferentes
clones y variantes de optrA relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles. |
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Saavedra, Sandra Yamile Bernal, Johan Fabian Montilla Escudero, Efrain Torres, German Rodríguez, Mabel Karina Hidalgo, Andrea Melissa Ovalle, María Victoria Rivera, Sandra Perez Gutierrez, Enrique Duarte, Carolina |
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RepoAGROSAVIA396702024-07-27T03:00:12Z Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 National surveillance of clinical isolates of Enterococcus faecalis resistant to linezolid carrying the optrA gene in Colombia, 2014-2019 Saavedra, Sandra Yamile Bernal, Johan Fabian Montilla Escudero, Efrain Torres, German Rodríguez, Mabel Karina Hidalgo, Andrea Melissa Ovalle, María Victoria Rivera, Sandra Perez Gutierrez, Enrique Duarte, Carolina Investigación agropecuaria - A50 Streptococcus faecalis Farmacología Ganadería y especies menores http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_16605 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_5760 Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab®. Se seleccionaron seis aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo. Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia. Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256μg/mL. La tipificación por Diversilab® indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfrG además de optrA y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos y tres variantes de optrA: ST16 (optrA-2), ST476 (optrA-5) y ST618 (optrA-6). El entorno genético de los aislamientos optrA-2 (ST16) presentó el segmento impB, fex, optrA, asociado a plásmido, mientras que en dos aislamientos (optrA-6 y optrA-5) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn6674-like. Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optrA presentan una alta diversidad genética, con diferentes clones y variantes de optrA relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles. Red PulseNet para América Latina y el Caribe (OPS/OMS). 2024-07-26T20:17:40Z 2024-07-26T20:17:40Z 2020 2020 article Artículo científico http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1 info:eu-repo/semantics/article https://purl.org/redcol/resource_type/ART http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 https://iris.paho.org/handle/10665.2/52679 1680 5348 http://hdl.handle.net/20.500.12324/39670 https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 reponame:Biblioteca Digital Agropecuaria de Colombia instname:Corporación colombiana de investigación agropecuaria AGROSAVIA spa Revista Panamericana De Salud Publica 44 1 10 Long KS, Vester B. Resistance to linezolid caused by modifications at its binding site on the ribosome. Antimicrob Agents Chemother. 2012; 56 (2): 603-612. Doi: 10.1128/AAC.05702-11. Rincón S, Panesso D, Díaz L, Carvajal LP, Reyes J, Munita JM et al. Resistencia a antibióticos de última línea en cocos Gram positivos: la era posterior a la vancomicina. 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