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Contributors: Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Clinique Maussins Nollet - Ramsay (FRANCE), Merck KGaA [Darmstadt, Germany], Merck & Co. Inc, Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), clinique des Maussins

Source: Scientific Reports
Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.8146. ⟨10.1038/s41598-022-11080-4⟩

2

Contributors: Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Sud Francilien, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut Gustave Roussy (IGR), Département d'hématologie [Gustave Roussy]

Source: Stem Cells Translational Medicine
Stem Cells Translational Medicine, 2022, 11 (9), pp.927-931. ⟨10.1093/stcltm/szac055⟩

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3

Contributors: Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Département de Chimie Moléculaire (DCM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)

Source: Molecular Pharmaceutics
Molecular Pharmaceutics, 2022, 19 (1), pp.235-245. ⟨10.1021/acs.molpharmaceut.1c00744⟩

4

Contributors: Institut des Neurosciences Paris-Saclay (NeuroPSI), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de l'Audition [Paris] (IDA), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Funding was provided by the European Community, Future and Emerging Technologies program—Human Brain Project (no. H2020-945539 to A.D.), Paris-Saclay University ‘Initiatives de Recherches Stratégiques’—NeuroSaclay and Icode (to B.B. and A.D.), Agence Nationale pour la Recherche (no. 12-PDOC-0006 to B.B., PARADOX to A.D.), Région Ile de France—DIM Cerveau Pensée—MULTISENSE (to B.B.), Fondation pour l’Audition (nos. FPA IDA02 and APA 2016-03 to B.B.), and the European Research Council (no. CoG 770841 DEEPEN to B.B.). B.B. thanks the Fondation pour l’Audition for their support to the Institut de l’Audition., ANR-12-PDOC-0006,SENSEMAKER,Traitement cortical multisensoriel et émergence de percepts supra-modaux(2012), ANR-17-CE16-0024,PARADOX,Le sommeil paradoxical décodé(2017), European Project: 945539,H2020,H2020-SGA-FETFLAG-HBP-2019,HBP SGA3(2020), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Source: Nature Neuroscience
Nature Neuroscience, Nature Publishing Group, 2022, 25 (10), pp.1327-1338. ⟨10.1038/s41593-022-01168-5⟩

5

Contributors: Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases [IHU ICAN], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Phénotypage du petit animal (UMS28), Sorbonne Université (SU), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Ingénierie Moléculaire pour la Santé (ex SIMOPRO) (SIMoS), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)

Source: Scientific Reports, Vol 11, Iss 1, Pp 1-16 (2021)
Scientific Reports
Scientific Reports, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-97493-z⟩
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2021, 11 (1), ⟨10.1038/s41598-021-97493-z⟩
Scientific Reports, 2021, 11 (1), pp.17982. ⟨10.1038/s41598-021-97493-z⟩

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6

Contributors: Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des sciences de l'ingénieur, de l'informatique et de l'imagerie (ICube), École Nationale du Génie de l'Eau et de l'Environnement de Strasbourg (ENGEES)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Strasbourg (INSA Strasbourg), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Matériaux et nanosciences d'Alsace (FMNGE), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Réseau nanophotonique et optique, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)

Source: Science Advances
Science Advances, American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2022, 8 (29), pp.eabo2295. ⟨10.1126/sciadv.abo2295⟩

7

Contributors: Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)

Source: International Journal of Molecular Sciences; Volume 23; Issue 13; Pages: 7419
International Journal of Molecular Sciences
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (13), pp.7419. ⟨10.3390/ijms23137419⟩

File Description: application/pdf

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8

Contributors: Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecole doctorale Cerveau Cognition et Comportement [Paris] (ED 158 - 3C), Sorbonne Université (SU), Photophysique et Photochimie Supramoléculaires et Macromoléculaires (PPSM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Normale Supérieure Paris-Saclay (ENS Paris Saclay), Institut des Neurosciences Paris-Saclay (NeuroPSI), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute of Neuroscience and Medicine [Jülich] (INM-1), Différenciation et communication neuronale et neuroendocrine (DC2N), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire des Maladies Neurodégénératives - UMR 9199 (LMN), Service MIRCEN (MIRCEN), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Psychiatry, Psychotherapy and Psychosomatics [Aachen], Rheinisch-Westfälische Technische Hochschule Aachen University (RWTH)

Source: Nature Communications
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.753. ⟨10.1038/s41467-022-28331-7⟩
Nature Communications 13(1), 753 (2022). doi:10.1038/s41467-022-28331-7
Nature Communications, Vol 13, Iss 1, Pp 1-17 (2022)

9

Contributors: Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des cellules souches pour le traitement et l'étude des maladies monogéniques (I-STEM), Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Généthon, Instituto Nacional de Rehabilitacion (INR), Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule (LBMC UMR 5239), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-16-CE16-0005,DM_Neuroglia,ARN toxiques et interactions neurogliales dans l'atteinte cerebrale de la dystrophie myotonique(2016), European Project: 683154,H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC),AstroWireSyn(2016), European Project: 722053,EU-GliaPhD - H2020-EU.1.3. H2020-EU.1.3.1.

Source: Nature Communications
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.3841. ⟨10.1038/s41467-022-31594-9⟩
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2022, 13 (1), pp.3841. ⟨10.1038/s41467-022-31594-9⟩

10

Contributors: Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Référence du Syndrome de Prader-Willi, CHU Toulouse [Toulouse], Service Psychiatrie et psychologie médicale [CHU Purpan], Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, University Hospital Münster - Universitaetsklinikum Muenster [Germany] (UKM), University of Illinois [Chicago] (UIC), University of Illinois System, Columbia University [New York]

Source: Genetics in Medicine
Genetics in Medicine, Nature Publishing Group, 2021, 23 (9), pp.1664-1672. ⟨10.1038/s41436-021-01185-y⟩

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Contributors: Mécanismes Centraux et Périphériques de la Neurodégénérescence, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ludwig-Maximilians University [Munich] (LMU), Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH), Laboratoire de neurosciences cognitives et adaptatives (LNCA), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CRBS - Centre de Recherche en Biomédecine de Strasbourg (Inserm UMS38/UNISTRA), University of Ulm (UUlm), Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen [Ulm] (DZNE), German Research Center for Neurodegenerative Diseases - Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen (DZNE), Centre de Neurochimie, Harvard Medical School [Boston] (HMS), Harvard University [Cambridge], Munich Cluster for systems neurology [Munich] (SyNergy), Technische Universität Munchen - Université Technique de Munich [Munich, Allemagne] (TUM)-Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU), Université de Strasbourg Inserm Faculté de médecine, Klinikum der Universitat Munchen, Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU), University hospital of Zurich [Zurich], Universität Ulm - Ulm University [Ulm, Allemagne], Massachusetts Institute of Technology (MIT), Ludwig-Maximilians University Hospital (LMU Munich), ANR-16-CE92-0031,EpiFUS,Rôle de FUS dans la régulation des modifications épigénétiques : conséquences pour la sclérose latérale amyotrophique et la démence frontotemporale(2016), ANR-16-CE16-0015,ToFU,Interactions entre TAU, FUS et TDP-43 dans les maladies neurodégénératives(2016), ANR-19-CE17-0016,SPREADALS,Propagation et toxicité des facteurs pathogéniques de la sclérose latérale amyotrophique(2019), University of Zurich, Liebscher, Sabine, Dupuis, Luc, Technische Universität München [München] (TUM)-Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU)

Source: Nature Communications
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), pp.3028. ⟨10.1038/s41467-021-23187-9⟩
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-23187-9⟩
Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-23187-9⟩
Nature Communications, Vol 12, Iss 1, Pp 1-19 (2021)

File Description: 2021_NatureCummun.pdf - application/pdf

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Contributors: European Molecular Biology Laboratory [Hamburg] (EMBL), Umeå University, Génomique et Epigénomique du Développement des Vertébrés - Genomics and Epigenomics of Vertebrate Development, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université - Institut de Formation Doctorale (IFD ), Sorbonne Université (SU), Centre d'Ingénierie génétique murine - Mouse Genetics Engineering Center (CIGM), Institut Pasteur [Paris], A.H. was supported by an EMBL Interdisciplinary Postdoctoral fellowship (EIPOD) under Marie Curie Actions COFUND from the E.U. This work was supported by a grant from the Deutsche Forschungsgemeinschaft (SP 1331/3-1, to F.S) and by the Institut Pasteur.

Source: Nature Communications, Vol 12, Iss 1, Pp 1-12 (2021)
Nature Communications
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12 (1), pp.439. ⟨10.1038/s41467-020-20714-y⟩

File Description: application/pdf

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Contributors: Bactériophage, bactérie, hôte - Bacteriophage, bacterium, host, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Collège Doctoral, Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Paris Center for Microbiome Medicine (FHU PaCeMM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 (INFINITE (Ex-Liric)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Biomics (plateforme technologique), Institut Pasteur [Paris]-Université Paris Cité (UPCité), Transcriptome et Epigénome (PF2), Institut Pasteur [Paris], Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Animalerie Centrale (plateforme) - Central Animal Facility (platform) (C2RA), M.L. is funded as part of the Pasteur-Paris University (PPU) International PhD Program. M.L. is funded by Institut Carnot Pasteur Maladies Infectieuses (ANR 11-CARN 017-01). L.D.S. is funded by a Roux-Cantarini Fellowship from the Institut Pasteur (Paris, France). L.C. is funded by a PhD Fellowship from the Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche, France, École Doctorale 394. Q.L.-B. is funded by École Doctorale FIRE - Programme Bettencourt. M.T. received a fellowship from Fondation DigestScience (Lille, France). The transcriptome and epigenome Platform is part of the France Génomique consortium (ANR10-NBS-09-08)., We thank Jorge Moura de Sousa for writing the customized R script for the pairwise comparisons between lists of genes from the different samples and for critically reading the manuscript. We thank Dwayne Roach and Anne Chevallereau for valuable discussions. We thank the Genetics of Biofilms team (Jean-Marc Ghigo) of Institut Pasteur and in particular Anne-Aurélie Lopes for training on the biofilm assays and Christophe Beloin for access to the ASKA plasmids collection. We thank the members of the Centre for Gnotobiology Platform of the Institut Pasteur (Thierry Angélique, Eddie Maranghi, Martine Jacob, Jérome Toutain, and Marisa Gabriela Lopez Dieguez) for their help with the animal work., ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010)

Source: Cell Host & Microbe
Cell Host & Microbe, 2022, 30 (4), pp.556-569.e5. ⟨10.1016/j.chom.2022.03.014⟩

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Contributors: Université Paris-Saclay, AgroParisTech, Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), Université Paris-Saclay-AgroParisTech-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Mathématiques et Informatique Appliquées (MIA-Paris), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Infection et inflammation (2I), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), RFI CASDAR program - French Ministry of Agriculture 1726, Mathématiques et Informatique Appliquées (MIA Paris-Saclay), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-AgroParisTech-Université Paris-Saclay

Source: BMC Bioinformatics, Vol 22, Iss 1, Pp 1-20 (2021)
BMC Bioinformatics
BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2021, 22 (1), pp.392. ⟨10.1186/s12859-021-04303-4⟩

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Contributors: MICrobiologie de l'ALImentation au Service de la Santé (MICALIS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Microbiota Interaction with Human and Animal (MIHA), Université Paris-Saclay, INRAE, AgroParisTech, Micalis Institute, Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire de Coprologie Fonctionnelle [Pitié-Salpêtrière], Sorbonne Université (SU), Physiopathologie et pharmacotoxicologie placentaire humaine : Microbiote pré & post natal (3PHM - UMR-S 1139), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Paris - UFR Médecine Paris Centre [Santé] (UP Médecine Paris Centre), Université de Paris (UP), Department of Computer Science, Atlanta (Georgia State University), Georgia State University, University System of Georgia (USG)-University System of Georgia (USG), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), This study was supported by INSERM, Sorbonne Université, the Fondation de France (00029519), and the Institute of Cardiometabolism and Nutrition (IHU-ICAN, ANR-10-IAHU-05). E.L. was supported by the Fondation Lefoulon Delalande/Institut de France and the Région Ile-de-France CORDDIM., ANR-10-IAHU-0005,ICAN,Institut de Cardiologie-Métabolisme-Nutrition(2010), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases [IHU ICAN], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Nutrition et obésités: approches systémiques (UMR-S 1269) (Nutriomics), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Physiopathologie et Pharmacotoxicologie Placentaire Humaine (U1139), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Immunité et métabolisme dans le diabète = IMmunity and MEtabolism in DIABetes [CRC] (IMMEDIAB Lab), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), University System of Georgia (USG), Mucosal microbiota in chronic inflammatory diseases [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)

Source: Diabetes
Diabetes, American Diabetes Association, 2021, 70 (9), pp.2067-2080. ⟨10.2337/db20-1177⟩
Diabetes, American Diabetes Association, 2021, 70 (9), p. 2067-2080. ⟨10.2337/db20-1177⟩
Diabetes, 2021, 70 (9), pp.2067-2080. ⟨10.2337/db20-1177⟩

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Contributors: Brigham and Women’s Hospital [Boston, MA], Harvard Medical School [Boston] (HMS), Institute of Medical Engineering & Science [Cambridge, MA] (IMES), Massachusetts Institute of Technology (MIT), Broad Institute of MIT and Harvard (BROAD INSTITUTE), Harvard Medical School [Boston] (HMS)-Massachusetts Institute of Technology (MIT)-Massachusetts General Hospital [Boston], Ragon Institute of MGH, MIT and Harvard, Koch Institute for Integrative Cancer Research at MIT [Cambridge, MA], University of Pittsburgh Medical Center [Pittsburgh, PA, États-Unis] (UPMC), Imagerie et Modélisation - Imaging and Modeling, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Department of Pharmacology, Toxicology, and Therapeutics [Kansas City, KS, USA], University of Kansas Medical Center [Kansas City, KS, USA], Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology [Cambridge], Dana-Farber Cancer Institute [Boston], Harvard Stem Cell Institute [Cambridge, USA] (HSCI), Harvard University [Cambridge], Massachusetts General Hospital [Boston, MA, USA], C..W. is supported by F32DK111151, the Cholangiocarcinoma Foundation Research Fellowship, and the American Liver Foundation Charles Trey, MD Memorial Post-doctoral Research Fellowship. W.G. is supported by R01DK090311, R01DK105198, R24OD017870, and the Claudia Adams Barr Program for Excellence in Cancer Research. W.G. is a Pew Scholar in Biomedical Sciences. A.K.S. was supported, in part, by the Searle Scholars Program, the Beckman Young Investigator Program, a Sloan Fellowship in Chemistry, the NIH (1DP2GM1194192 & RM1HG0061931), and the MIT Stem Cell Initiative through Fondation MIT. U.A. is supported by R01DK098414. S.P.M is supported by NIH/NIDDK P30DK120531, Pittsburgh Liver Research Centre Grant, and NIH/NIDDK (DK62277, DK100287, and CA204586)

Source: Nature Communications, Vol 11, Iss 1, Pp 1-12 (2020)
Nature Communications
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2020, 11 (1), pp.5785. ⟨10.1038/s41467-020-19558-3⟩

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Contributors: Microbiote des insectes vecteurs / Microbiota of Insect Vectors [Cayenne, Guyane française], Vectopôle Amazonien Emile Abonnenc [Cayenne, Guyane française], Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Biologie des Interactions Hôte-Parasite - Biology of Host-Parasite Interactions, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Parasites et Insectes vecteurs - Department of Parasites and Insect Vectors, Institut Pasteur [Paris], This work is funded by the French Government’s Investissement d’Avenir program, Laboratoire d’Excellence ‘Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases’ (grant no. ANR-10-LABX-62-IBEID) and by ANR JCJC MosMi to M.G. (grant no. ANR-18-CE15-0007)., ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-18-CE15-0007,MosMi,Remodelage du microbiote de moustique pour étudier son impact sur la transmission du paludisme(2018)

Source: Trends in Parasitology
Trends in Parasitology, Elsevier, 2021, 37 (10), pp.853-855. ⟨10.1016/j.pt.2021.07.007⟩

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Contributors: Hôpitaux Pédiatriques de Nice Lenval (CHU-Lenval), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)

Source: American Journal of Medical Genetics Part A
American Journal of Medical Genetics Part A, Wiley, 2021, 185 (6), pp.1841-1847. ⟨10.1002/ajmg.a.62155⟩

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Contributors: Hôpital Nord (Saint Etienne), Université Grenoble Alpes (UGA), Radiopharmaceutiques Biocliniques, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, Hopital Universitaire de Saint-Etienne, Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)

Source: Diagnostics; Volume 12; Issue 2; Pages: 388
American Journal of Cancer Research
American Journal of Cancer Research, 2022, 12 (3), pp.1116-1128. ⟨10.3390/diagnostics12020388⟩
American Journal of Cancer Research, e-Century Publishing, 2022, 12 (3), pp.1116-1128. ⟨10.3390/diagnostics12020388⟩
Diagnostics
Diagnostics, MDPI, 2022, 12 (2), pp.388. ⟨10.3390/diagnostics12020388⟩

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Contributors: Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences [Vienna, Austria] (CeMM ), Austrian Academy of Sciences (OeAW), Medizinische Universität Wien = Medical University of Vienna, Department of Pathology [Stanford], Stanford Medicine, Stanford University-Stanford University, Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), GIGA [Université Liège], Université de Liège, Sean N. Parker Center for Allergy and Asthma Research [Stanford], Department of Microbiology and Immunology [Stanford], ANR-18-CE18-0023,AllergyVACS,Développement d'un vaccin thérapeutique pour les maladies allergiques(2018), European Project: 802041

Source: Allergy
Allergy, Wiley, 2022, 77 (2), pp.499-512. ⟨10.1111/all.14852⟩