| Sumario: | En el frijol común uno de los principales problemas relacionados con su producción es el daño ocasionado por enfermedades, entre las más relevantes está la mancha angular. Esta enfermedad está delimitada a regiones tropicales y subtropicales, causa reducciones en rendimientos de 40% hasta 80% de la producción. El objetivo fue identificar y utilizar marcadores moleculares RAPD y SCAR como herramientas para la selección en el mejoramiento por resistencia genética del frijol común a la mancha angular en Zamorano. El material que se usó fue de una población segregante F4 identificada como ALS 9951, derivada de la cruza de Tío Canela-75 (susceptible) ´ G06727 (resistente). El procedimiento a seguir incluyó la siembra, inoculación y evaluación en camas de infección de las poblaciones F5 y F6 y los padres. La reacción fenotípica a la incidencia de la enfermedad se utilizó como referencia en la búsqueda de marcadores moleculares ligados a la misma. Para ello, se utilizaron 44 cebadores RAPD. Se evaluó la reacción fenotípica a la inoculación en el laboratorio la presencia de bandas polimórficas ligadas a esta reacción fue la variable evaluada usando la prueba de Chi-cuadrado (c2) de Pearson para bondad de ajuste de las proporciones fenotípicas y genotípicas esperadas y observadas. Se usó el marcador molecular SCAR NO2 que indica la presencia del gen Phg–2 que fue adaptado para las condiciones del laboratorio de Biología Molecular de Zamorano y se encontró que no hay ajuste con un P 0.01 demostrándose así que los valores observados se atribuyen al azar; por esta razón es importante la identificación de marcadores moleculares RAPD como primer paso para encontrar marcadores moleculares potenciales. Se lograron identificar cinco marcadores RAPDs WO61200, G31400 , G31100, W091100, PO9 300 y B101200 ligados a la resistencia a la mancha angular, empleando mezclas compuestas de ADN de plantas resistentes y susceptibles, los cuales se comprobaron en la siguiente generación en la población F6; estos marcadores fueron utilizados en plantas individuales (F6). El marcador G31400 muestra el ajuste más alto, considerándolo así como el marcador molecular más confiable en este estudio.
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